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几年后，陈杰到了潘多拉星球，他发现这里的美景简直无法用语言来形容，高达几百米的参天巨树、星罗棋布飘浮在空中的群山、色彩斑斓充满奇特植物的茂密雨林、晚上各种动植物还会发出光，就如同梦中的奇幻花园。而影院里面的观众看到这一幕后全部抽了一口冷气，电影里面的风景太漂亮了，漂亮的太不真实了。
唐尹看了眼观众的反应后笑了，这个场景可是花了不少心思的，当初电影还没筹拍的时候，唐尹就根据自己的记忆让工业光魔的人用电脑模拟了一番这些场景了，而一些实际的内容则是直接跟他记忆中的那部影片一样，跑到张家界取的实景。
电影还在继续，虽然环境十分漂亮，但是这里到处也充满这危险。很快陈杰就体验到了这里的危险，一头死圣兽（潘多拉星球一种本土生物）与他狭路相逢，在逃命过程中陈杰与队友失去了联系。在晚上的时候又被一群土狼袭击，陈杰奋起战斗，在整个战斗的过程中陈杰寡不敌众危在旦夕，危急关头中一支箭射死了毒狼，陈杰得救了。
这个打斗过程完全是特效做出来得，不过效果却非常不错，看着也没有违和感和处处漏洞得感觉。
救陈杰的是纳威族的公主，英雄被美女相救的老套故事，陈杰从她口中了解到了更多关于潘多拉星球的知识。纳威族人一直以来都与潘多拉星球的其他物种和谐相处，过着一种简朴天然的生活，陈杰在和这个纳威女孩的相处过程中逐渐转变了对人类来这里采矿的看法，他意识到已经找到值得为之战斗的东西了。
不过陈杰如果要加入纳威族人对抗人类入侵者的战争，要付出很大的代价：他不能永远呆在“化身”中，当“化身”——克隆纳威人睡觉时，他就会回到自己半身不遂的人类身体中，只有通过专门的连接设备才能重新回到“化身”中。一旦与自己的同胞为敌，他就失去了与“化身”结合的可能，只能困在残疾的身体里，并失去那个他越来越喜欢的纳威女孩。
最后，人类在利益的驱动下，派遣了战机去摧毁纳威族人所生存的家园树，尽管陈杰等人一再争取希望可以不要那么做，但是采矿公司还是决意要去摧毁。陈杰与他们协商，自己去和纳威族人交涉，让他们离开那颗大树，然而当他说明了一切之后，纳威族人都很愤怒，特别是陈杰喜欢的那个纳威族人女孩也是很愤怒，纳威族人就把陈杰和一名女教授一起捆在了刑架上了。
采矿公司派遣的战机发现他们协商失败了，于是就下令开火，摧毁了他们前进的障碍——纳威族人赖以生存的那棵巨树，纳威族人的领袖也被炮火炸死。剧情开始变的紧张起来，不过实际上还是脱不了一些老旧的梗，只不过换了个新瓶装了而已。
没有了生存之地的纳威族人被迫暂居神树之下，而陈杰等人的正义行为因为和采矿公司的利益相冲，被他们关了起来。后来，他们借机驾机逃跑了，陈杰骑着“魅影”到达了纳威族人暂居的神树下，呼吁纳威族人作出反抗，几经周折，他终于又得到纳威族人的信任。
